蕨类中心也称蕨类园，是仙湖植物园蕨类植物保育和展示的主要场所，集科学研究、自然教育和旅游观光等功能为一体，面积约2公顷。该中心位于弘法寺北侧，是植物园内地势最高的专类园，园内地势高差变化大，中间有一条陡峭的溪谷，两侧有木质栈道环绕，次生林发育良好，为大多数蕨类植物提供了良好的栖息地，这里保育了来自全球各地的大约500种蕨类植物，大部分来自我国热带、亚热带地区。入口左侧有一间科普展馆“知蕨馆”，介绍蕨类的基础知识。
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